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坤兑河,又作坤头河、坤都伦河,位于中华人民共和国内蒙古自治区东部的一条河流,是老哈河左岸支流,发源于宁城县存金沟乡西北小梁子村韭菜沟附近,七老图山脉棒槌山东麓,东北流至草沟门村转东南流,于存金沟乡驻地以北再转东北流,经三座店镇、大城子镇、小城子镇等地,于喀喇沁旗西桥镇恩州村折向东,成为宁城县与喀喇沁旗之间的界河,东流至宁城县汐子镇北山咀村黑牛湾汇入老哈河。河流全长101.5千米,流域面积1748.64平方千米,河道平均比降1.9‰,年均径流量1.02亿立方米。坤兑河上游流经土石山区,植被较差,水土流失较重,中下游沿岸为农业区,是内蒙古商品粮和甜菜生产基地之一。
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布卡莱穆(Bucalemu)是秘鲁的一座沿海村镇,位于奥伊金斯将军解放者大区卡德纳尔卡罗省的帕雷多内斯,其北距皮奇莱穆km。据2002年人口普查,该地区人口为789。
布卡莱穆之名源于马普切语中的“Vuka”,意为“大”;“lemu”则为西班牙语中“森林”之意。
该地区在2010年智利大地震中遭遇严重破坏,海啸侵袭了布卡莱穆,半数建筑尽毁,尽管没有造成人员伤亡但使全镇陷入了停水停电且没有信号的局面。
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染色质免疫沉淀-测序(ChIP-sequencing,简称为ChIP-seq)被用于分析蛋白质与DNA的交互作用。该技术将染色质免疫沉淀(ChIP)与大规模并行DNA测序结合起来以鉴定与DNA相关蛋白的结合部位。其可被用于精确绘制任意目的蛋白在全基因组上的结合位点。在此之前,ChIP-on-chip是研究这些蛋白-DNA联系的最常用的技术。
ChIP-seq主要用于确定转录因子和其他染色质相关蛋白质如何影响表型影响机制。确定蛋白质如何与DNA相互作用来调控基因表达对于充分了解许多生物过程和疾病状态至关重要。这种表观遗传信息与基因型和表达分析是互补的。 ChIP-seq技术目前主要被看作是需要杂交阵列的ChIP-on-Chip的替代品。 这必然会引入一些偏差,因为一个阵列仅限于有固定数量的探针。相反,尽管不同测序技术的测序偏差尚未完全了解,测序被认为偏差较小。
与转录因子和其他蛋白质直接物理相互作用的特定DNA位点可通过染色质免疫沉淀被分离出来。 ChIP产生在活体内In vivo兴趣蛋白质结合的目标DNA位点文库。 大规模平行序列分析与全基因组序列数据库结合使用来分析任何蛋白质与DNA的相互作用模式或任何表观遗传染色质修饰的模式。 这可以应用于一系列ChIP蛋白和修饰,如转录因子,聚合酶和转录机制,结构蛋白质,蛋白修饰和DNA修饰。 作为对特异性抗体依赖性的替代方法,已经开发了不同的方法来发现基因组中所有核小体耗尽的(nucleosome-depleted)或核小体扰动(nucleosome-disrupted)的活性调控区的超集,如DNase-Seq和FAIRE-Seq。
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