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当只有一个或几个细胞可用时,MALBAC 可用于扩增DNA并随后对其进行测序,例如用于分析血液中筛选出的肿瘤细胞、产前筛查或法医样本。启动该过程只需要少量起始模板(pg级的DNA),因此它是对单个人体细胞进行测序的理想方法。
单细胞测序通常具有很高的假阴性突变率。假阴性突变率是指未检测到真正突变的概率,这可能是由于等位基因丢失或脱落导致的扩增偏倚造成的。与其他单细胞测序技术相比,MALBAC的序列覆盖均匀性增强了SNP的检测并降低了等位基因丢失率。 当杂合子的等位基因无法扩增,导致检测出“假纯合子”时,等位基因丢失率会增加。这可能是由于DNA模板浓度低,或者模板扩增不均匀导致杂合子的一个等位基因被复制更多。与等位基因丢失率大约为65%的MDA相比,MALBAC要低得多(大约 1%)。与批量测序相比,MDA有41%的SNP检测效率,而MALBAC有76%的SNP检测效率。 据报道,MALBAC的假阳性率也很低。 MALBAC产生的假阳性突变主要是由 DNA聚合酶在第一个扩增循环中引入的错误造成的,并在随后的循环中进一步复制。通过对源自单个细胞的谱系中的2-3个细胞进行测序以验证SNP的存在,以及通过对来自单独谱系的无关细胞进行测序来消除测序和扩增错误,可以消除假阳性。
* 由于只需要少量的模板DNA,操作者或环境对目标DNA的污染可能会混淆测序结果。
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* 2018年,5月22日首本个人写真集「gradation」发售。。7月演出电视剧《热舞啦啦队》时透露,中小学时就参加过千叶县的啦啦舞队「☆SHINING☆PLANETS☆」并在2010年的美国啦啦舞大赛上获得优胜。12月首次主演电影红刃(レッド・ブレイド)。
* 2019年,7月24日发行第2本写真集「じゃじゃうま」。
* gradation(ぐらでーしょん)(2018年5月22日,讲谈社,摄影:Takeo Dec.)ISBN 978-4065121474
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